SKB Kota Yogyakarta menyelenggarakan 2 jenis Kelas untuk Program Kesetaraan , yaitu Kelas Reguler dan Kelas Karyawan (Blended Learning). Untuk Kelas Reguler, program kegiatan pembelajaran meliputi : tatap muka, tutorial, dan mandiri. Sedangkan untuk Kelas Karyawan, kegiatan pembelajaran menggunakan metode Blended Learning yaitu perpaduan antara tatap muka dan daring/pembelajaran online. Untuk pembelajaran tatap muka kelas reguler dilaksanakan 4 kali/minggu setiap hari Senin, Selasa, Rabu dan Kamis pukul 08.00-12.30 untuk Paket B dan pukul 13.00 - 17.15 untuk Paket C bertempat di UPT SPNF SKB Kota Yogyakarta Unit I (Gayam), Jl. Bung Tardjo No 9A Yogyakarta. Untuk Program PAUD, dilaksanakan setiap hari Senin-Jumat pukul 08.00 - 10.00 WIB bertempat di SKB Unit II (Batikan) , Jl. Kalimanunggal No 677B Umbulharjo, Yogyakarta.